Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TFIP11Q9UBB9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TFIP11Q9UBB9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms