Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
REREQ9P2R6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
REREQ9P2R6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms