Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms