Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KLHL42Q9P2K6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms