Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
MBD5Q9P267 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MBD5Q9P267 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MBD5Q9P267 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MBD5Q9P267 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MBD5Q9P267 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MBD5Q9P267 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MBD5Q9P267 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MBD5Q9P267 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MBD5Q9P267 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MBD5Q9P267 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MBD5Q9P267 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MBD5Q9P267 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MBD5Q9P267 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MBD5Q9P267 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MBD5Q9P267 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MBD5Q9P267 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
MBD5Q9P267 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MBD5Q9P267 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MBD5Q9P267 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MBD5Q9P267 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MBD5Q9P267 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MBD5Q9P267 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
MBD5Q9P267 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MBD5Q9P267 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MBD5Q9P267 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MBD5Q9P267 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MBD5Q9P267 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MBD5Q9P267 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms