Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC88CQ9P219 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms