Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HCN3Q9P1Z3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN3Q9P1Z3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms