Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDP1Q9P0J1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDP1Q9P0J1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDP1Q9P0J1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDP1Q9P0J1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDP1Q9P0J1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PDP1Q9P0J1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PDP1Q9P0J1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PDP1Q9P0J1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PDP1Q9P0J1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PDP1Q9P0J1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDP1Q9P0J1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms