Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GDE1Q9NZC3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GDE1Q9NZC3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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