Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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RDH8Q9NYR8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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RDH8Q9NYR8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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RDH8Q9NYR8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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RDH8Q9NYR8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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RDH8Q9NYR8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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RDH8Q9NYR8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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