Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXC10Q9NYD6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
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