Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TOR4AQ9NXH8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOR4AQ9NXH8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOR4AQ9NXH8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOR4AQ9NXH8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOR4AQ9NXH8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOR4AQ9NXH8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOR4AQ9NXH8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOR4AQ9NXH8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOR4AQ9NXH8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOR4AQ9NXH8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOR4AQ9NXH8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOR4AQ9NXH8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOR4AQ9NXH8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOR4AQ9NXH8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOR4AQ9NXH8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOR4AQ9NXH8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TOR4AQ9NXH8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOR4AQ9NXH8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TOR4AQ9NXH8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOR4AQ9NXH8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOR4AQ9NXH8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOR4AQ9NXH8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOR4AQ9NXH8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOR4AQ9NXH8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOR4AQ9NXH8 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TOR4AQ9NXH8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOR4AQ9NXH8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TOR4AQ9NXH8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TOR4AQ9NXH8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms