Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR3EQ9NVU0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms