Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FBXO28Q9NVF7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO28Q9NVF7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms