Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms