Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LTBP3Q9NS15 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTBP3Q9NS15 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
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