Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HELLSQ9NRZ9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms