Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNX15Q9NRS6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms