Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NRIP3Q9NQ35 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms