Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
A4GALTQ9NPC4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms