Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SEBOXQ9HB31 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms