Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LIN28AQ9H9Z2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LIN28AQ9H9Z2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms