Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TDRD3Q9H7E2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TDRD3Q9H7E2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms