Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF541Q9H0D2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms