Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLIRPQ9GZT3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms