Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ6

NPFFR1, Neuropeptide FF receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPFFR1Q9GZQ6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPFFR1Q9GZQ6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NPFFR1Q9GZQ6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms