Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BHLHE41Q9C0J9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHE41Q9C0J9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms