Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H9

SRCIN1, SRC kinase signaling inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCIN1Q9C0H9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms