Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AMBRA1Q9C0C7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AMBRA1Q9C0C7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms