Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CRNKL1Q9BZJ0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRNKL1Q9BZJ0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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