Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PUS3Q9BZE2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PUS3Q9BZE2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms