Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KDM5DQ9BY66 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms