Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PLVAPQ9BX97 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms