Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSBP3Q9BWW4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms