Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms