Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAGR1Q9BTK6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAGR1Q9BTK6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms