Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERPUD2Q9BSE4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms