Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRQ6

CHCHD6, MICOS complex subunit MIC25, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD6Q9BRQ6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CHCHD6Q9BRQ6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms