Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC30■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC30■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC30■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
FYCO1Q9BQS8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms