Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms