Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
USB1Q9BQ65 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms