Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUSP9Q99956 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms