Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PIK3R4Q99570 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PIK3R4Q99570 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms