Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RNF2Q99496 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RNF2Q99496 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms