Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CRAMP1Q96RY5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRAMP1Q96RY5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms