Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCGB3A2Q96PL1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms