Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AGAP4Q96P64 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms