Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
JSRP1Q96MG2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms