Protein–RNA interactions for Protein: Q96KK3

KCNS1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, humanhuman

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Length 526 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1Q96KK3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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KCNS1Q96KK3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KCNS1Q96KK3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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