Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
VCPIP1Q96JH7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VCPIP1Q96JH7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms